Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a3Q9QZS0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Col4a3Q9QZS0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Col4a3Q9QZS0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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