Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trpc3Q9QZC1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trpc3Q9QZC1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms