Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms