Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tomm40Q9QYA2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tomm40Q9QYA2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Tomm40Q9QYA2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tomm40Q9QYA2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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