Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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