Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim44Q9QXA7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim44Q9QXA7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms