Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Csnk1eQ9JMK2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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