Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vstm2bQ9JME9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms