Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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