Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlr5Q9JLF7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms