Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Scamp5Q9JKD3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp5Q9JKD3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms