Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ybx3Q9JKB3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ybx3Q9JKB3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms