Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gpa33Q9JKA5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms