Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacna1fQ9JIS7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1fQ9JIS7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms