Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmod3Q9JHJ0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmod3Q9JHJ0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms