Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim39Q9ESN2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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