Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rb1cc1Q9ESK9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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Rb1cc1Q9ESK9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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