Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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DysfQ9ESD7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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DysfQ9ESD7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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DysfQ9ESD7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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DysfQ9ESD7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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DysfQ9ESD7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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DysfQ9ESD7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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DysfQ9ESD7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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DysfQ9ESD7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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DysfQ9ESD7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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DysfQ9ESD7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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DysfQ9ESD7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
DysfQ9ESD7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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