Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clstn1Q9EPL2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms