Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
MNCb-2875Q9DCB3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
MNCb-2875Q9DCB3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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