Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Csnk1dQ9DC28 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Csnk1dQ9DC28 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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