Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf6Q9DBU5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf6Q9DBU5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf6Q9DBU5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf6Q9DBU5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf6Q9DBU5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Rnf6Q9DBU5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf6Q9DBU5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf6Q9DBU5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf6Q9DBU5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf6Q9DBU5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf6Q9DBU5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf6Q9DBU5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf6Q9DBU5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rnf6Q9DBU5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms