Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm34809-201ENSMUST00000220510 1135 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm3550-201ENSMUST00000105038 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms