Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms