Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot8Q9D8X5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms