Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nop56Q9D6Z1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Nop56Q9D6Z1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Nop56Q9D6Z1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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