Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ttc9bQ9D6E4 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ttc9bQ9D6E4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms