Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Gm3404Q9D506 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm3404Q9D506 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm3404Q9D506 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm3404Q9D506 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm3404Q9D506 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm3404Q9D506 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Gm3404Q9D506 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm3404Q9D506 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm3404Q9D506 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Gm3404Q9D506 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm3404Q9D506 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm3404Q9D506 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm3404Q9D506 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Gm3404Q9D506 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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