Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lonrf3Q9D4H7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms