Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfap53Q9D439 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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