Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spns3Q9D232 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Spns3Q9D232 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms