Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Lmbr1lQ9D1E5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Lmbr1lQ9D1E5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms