Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Syf2Q9D198 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms