Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms