Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Zbed3Q9D0L1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zbed3Q9D0L1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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