Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rfc5Q9D0F6 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rfc5Q9D0F6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rfc5Q9D0F6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rfc5Q9D0F6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rfc5Q9D0F6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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