Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gins3Q9CY94 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gins3Q9CY94 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms