Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Sgo1Q9CXH7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sgo1Q9CXH7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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