Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lrrc17Q9CXD9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms