Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RpainQ9CWY9 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms