Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpusd4Q9CWX4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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