Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Malsu1Q9CWV0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms