Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NubplQ9CWD8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NubplQ9CWD8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms