Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms