Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Q9CQM1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q9CQM1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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