Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccer1Q9CQL2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms