Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufb9Q9CQJ8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms