Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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