Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chmp3Q9CQ10 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chmp3Q9CQ10 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms