Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms